Sujet de thèse : Impact des changements globaux sur la propagation spatio-temporelle d’agents pathogènes transmis par les moustiques

Ecole doctorale : SIBAGHE, Université de Montpellier II

Sujet de thèse susceptible d'obtenir un Contrat doctoral, contrat Jeune Scientifique (CJS).

Les candidats intéressés doivent postuler en ligne sur le site Sibaghe http://www.sibaghe.univ-montp2.fr/ (pour retrouver le sujet détaillé il faut cliquer sur theses / Sujets de l'ED Sibaghe / CMAEE) et nous envoyer un dossier de candidature.

Avant le 18 juin, nous devons envoyer à l'école doctorale une liste de 3 noms maximun de candidats. Puis une commission d'admissibilité de l'école doctorale évaluera, les 28 et 29 juin, l'adéquation du ou des candidat(s) au sujet et sélectionnera les candidats. Un jury auditionnera les 9, 10 et 11 juillet tous les candidats sélectionnés (parmi tous les sujets proposés à l'école doctorale). A l'issue de ce jury, un classement sera effectué. Les candidats/sujets les mieux classés seront alors financés.

Les candidats intéressés peuvent contacter les encadrants :

• Thomas Balenghien (thomas.balenghien@cirad.fr),

• Pauline Ezanno (pauline.ezanno@oniris-nantes.fr)

• Annelise Tran (annelise.tran@cirad.fr).

Date de début : 1^er septembre 2012

Directeur de thèse: Jérémy BOUYER

+ (221) 77 184 - + (221) 33 832 - bouyer@cirad.fr

Correspondant : Thomas Balenghien

04 67 59 37 24 - +33 4 67 59 37 - thomas.balenghien@cirad.fr

Spécialité : MP - Microbiologie/Parasitologie

Encadrement : Il s’agit d’un co-encadrement. La thèse sera co-dirigée par J. Bouyer (entomologie médicale) et P. Ezanno (modélisation épidémiologique) et co-encadrée par T. Balenghien (CIRAD, entomologie médicale) et A. Tran (CIRAD, géomatique).

Thématique : Entomologie médicale / épidémiologie

Détail : La propagation spatio-temporelle des maladies vectorielles est fortement influencée par les facteurs environnementaux (paysage, localisation et abondance des hôtes et des vecteurs, etc.) et climatiques (température, humidité, etc.). La structure du paysage et la localisation des populations de vecteurs et d’hôtes en découlant, fortement associées à l’exposition des hôtes à l’infection par un agent pathogène vectorisé, varient dans le temps et l’espace. Les changements globaux, climatiques et liés à l’anthropisation du milieu, modifient la structure du paysage ainsi que la dynamique de population de vecteurs et donc en conséquence impactent sur l’émergence et la diffusion de maladies vectorielles. Cependant, il est difficile de quantifier voire de qualifier cet impact.

Une approche intégrative est nécessaire pour considérer conjointement la dynamique de population du vecteur et la dynamique épidémique, toutes deux variant dans le temps et l’espace. Une approche par modélisation s’avère pertinente pour représenter ce système biologique complexe, permettant de coupler les composantes spatiale et temporelle et donc de prendre en compte leurs interactions. Cependant, les modèles épidémiologiques spatio-temporels de propagation de maladies vectorielles représentent généralement une dynamique de population du vecteur très simplifiée. Le cycle de vie du vecteur étant incomplet, de tels modèles ne permettent pas d’évaluer l’effet de changements globaux sur la dynamique de population de vecteurs et sur la propagation des maladies associées.

L’objectif de cette thèse est d’évaluer l’impact des changements globaux sur la propagation spatio-temporelle d’agents pathogènes vectorisés, avec comme exemple de vecteurs les moustiques, vecteurs d’agents pathogènes majeurs en santé humaine et animale. Une approche par modélisation permettra de coupler un modèle épidémiologique de maladie vectorielle (tel que publiés dans la littérature) avec un modèle spatio-temporel de dynamique de population de moustiques (à développer dans le projet de thèse). Le modèle en résultant sera utilisé pour identifier les principaux paramètres influant sur l’amplification et la diffusion des agents pathogènes et des populations de vecteurs. Ces paramètres sont des paramètres critiques, à définir précisément et permettant le contrôle du système biologique. Ils sont souvent difficilement mesurables sur le terrain ou via des expérimentations. Le modèle sera utilisé pour évaluer un panel de scénarios de changements globaux, ainsi que de potentielles stratégies de contrôle des épidémies, visant soit les vecteurs, soit les hôtes.

Profil recherché: Master en biomathématiques, modélisation des systèmes biologiques, écologie ou épidémiologie